①同名离子的搬迁，离子交流膜的挑选透过性往往不可能是*的，因而总会有少数的相反离子透过交流膜；
②离子的浓差分散，由于浓缩室和淡化室中的溶液中存在着浓度差，总会有少数的离子由浓缩室向淡化室分散搬迁，然后下降了渗析功率；
③水的浸透，虽然交流膜是不允许溶剂分子透过的，可是由于淡化室与浓缩室之间存在浓度差，就会使局部溶剂分子（水）向浓缩室浸透；
④水的电渗析，由于离子的水合效果和形成双电层，在直流电场效果下，水分子也可从淡化室向浓缩室搬迁；
⑤水的极化电离，有时由于工作条件不良，会逼迫水电离为氢离子和氢氧根离子，它们可透过交流膜进入浓缩室；
⑥水的压渗，由于浓缩室和淡化室之间存在流体压力的不同，迫使水分子由压力大的一侧向压力小的一侧浸透。
明显，这些非须进程对电渗析是不利因素，可是它们都可以经过改动操作条件予以防止或操控。