（1）、水的预处理是保证电渗析器正常运行的因素之一，因此水进入电渗析器前须进行必要的预处理，保证进入电渗析器的原水水质符合以下指标。
a：浊度：≯3mg/1; b:含铁总量：<0.3mg/1;
c:含锰总量：<0.1mg/1; d:色度<15度；
e:耗氧量：<3mg/1(KMno4) f:水温：5-40℃
g:污染指数：<7
（2） 注意起动时，须先通水，后通电，停止时先断电，后断水，严禁停水不停电。
（3） 淡水流量与浓、极水流量的比例要调节适当，为防止浓水渗漏，浓水、极水的压力可适当减小，一般小0.2×9.8×104Pa。
（4） 视水质情况，电渗析器工作2-8小时后要调换一次电极。
（5） 膜堆上禁止放金属物件，以防产生短路。