(1)电渗析器在运行开车时，应先通水，后通电；在停车时，应先停电后停水。
(2)浓、淡、极水的阀门应做到同时缓侵开启，要均匀、切勿猛开猛关。并控制好压力：通常使淡水室压力比浓水、极水压力高出4．9---9．8kPa(0．05----0．1kgf／cm2)。
(3)通电时，电压应逐步升高，直到电流稳定在工作点为止。
(4)运行期间，应定期测定淡、浓、极水的流量和压力；记录工作电压、电流；测定原水、淡水、浓水的电阻率、温度；定期分析原水浊度、耗氧量、游离氯、氯根、硬度和含盐量等。
(5)在暂停运行时，应保持膜在湿润状态，避免干缩；如果长期停运时，应将设备解体，并按期定保存好各部件。