防止结垢的主要措施是控制操作电压。通过调整试验选择适当的操作电压使电流低于或等于运行流量下的极限电流。极限电流与流量、出入口含盐量有关。一般采用电压-电流法测试。
每次装机后都应测试不同流量下的极限电流。一般可测定额定负荷的40%、60%、80%和*流量下的极限电流及其相应的电压。
应该指出，现场工业设备实测的电压-电流关系曲线可能有两种情况。一是带有过滤区，可能是多层电渗析水分配不均所致。二是有两个极化点，对于没被污染的膜而言，从下而上*点是阳膜先极化，但应指出， 由于一般含盐量的天然水中含有HCO3-，此时水中的PH值主要取决于HCO3-。
有两个极化点时，操作电压应根据水质和运行实践确定。如欲在第二个高极化点的电压下运行，当配合2h切换一次电极防垢时，一周之内脱盐率下降值不得大于10%，否则应降低工作电压。
当原水经石灰处理后含有0.2mmol/L OH-或原水PH>8.3 且采用浓水循环（浓缩倍率3~6倍）时，结垢时的操作电流一般要低于第二极化或低于带有过滤区的极化点C。
显然，对于那些结垢倾向小、水质稳定并经预处理的原水或则经过预软化，或则对浓水加酸调节PH<7~8.3的水；在第二极化点或过渡区极化点C甚至略高于此值运行，是可以稳定脱盐的。