膜是电渗析器的关键部件，易于污染、中毒和老化，而且价格也比较贵，因此用户务必要掌握对它的维护、保养方法和了解它受污染后如何恢复效能，即所谓复苏。
在使用一台电渗析器前，即应了解所用的膜是什么品种，应根据膜生产厂提供的说明书掌握此膜的性能。例如上海某厂的异相膜虽可以风干保存，但出厂产品中可能有余酸残存，买来后应把膜边网布裁去，用水浸洗，除去余酸，以免干态保存中酸破坏增强网布，使膜易于破碎。如膜较长时间浸泡在水中保存，则应防止霉菌污染。美国某公司介绍在水中加入少量山梨酸溶液的方法，即每升水中加入10mL溶有1g山梨酸的溶液，经上海某单位使用，却能在梅雨季节防止膜上产生霉菌。又如日本生产的均相膜，在产品包装袋中即附有说明书，介绍膜不宜干放，防止破裂，应放在10%NaCl溶液中，并且要求务随意折叠，防止异物硬性划伤等。
拆框清洗膜时也应注意，勿随便放置，避免损伤，膜面常有一层黏状附着物，宜用纱布或软毛刷清洗。山西阳泉某煤矿水站自制了一台洗膜台，将膜在平台上推过，用马达带动边喷水、便用软毛刷刷洗，是用膜较多的水站可采用的方法。
虽然前期已讨论过电渗析前应有预处理，电渗析器堆进口水的水质有一定的要求指标，但在长期运行中，日积月累膜还是会有些污染，而且水源不一，进水水质指标也并不可能全能控制。因此为了保持电渗析器的长期稳定运行，对使用时如何使受污的膜恢复效能——所谓膜的复苏也是很重要的。复苏的方法可以是物理方法或是化学方法。我国*常用的是倒换电极和定期酸洗。
1.物理方法
膜复苏的物理方法主要是定期倒换电极极性，这是消除电渗析器中膜面上污垢的有效措施。由于倒换了极性，阴、阳离子改变了迁移方向，同时浓、淡水室也相互更换，长促使部分结构溶解或松散、粉碎开随水流去，一般2~8h倒极一次，已成为
电渗析器操作运行中的例行操作规程。虽然国外20世纪60年代初期即有此方面研究报道，但直至70年代美国某公司才称之为EDR方式（15~30min倒极一次）用于其装置上，作为改进电渗析器运行效果的新措施。
此外还有报道用定期反冲洗的方法，这在我国也有采用。还有用超声波冲洗，通入空起来减少污垢的，都尚在研究中。
2.化学方法
这种现场通入溶液清洗的方法，国外称之为CIP(Clean In Place)。*常用的是定期酸洗的方法，这在国内也已成为运行操作的常规操作事项之一。酸洗周期应根据电渗析器运行效率下降的趋势而定，一般1~4周一次。酸洗市常用酸盐，含量宜用1%~2%。
针对阴离子膜的有机污染，也有仿照离子交换树脂清除有机物的方法，用盐、碱混合溶液来清洗。一般是先用盐酸来清洗，再冲清去除余酸至pH值3~4后，改用1%~2%NaOH溶液作为溶剂配制的10%NaCl清洗。所用NaOH溶液含量不宜超过2%，以免破坏膜性能。
近年来国外也有用酶制剂、氧化剂或表面活性剂的报道，这些都还停留在研究中。对一种特定的膜，未经试验，不宜轻易采用，特别是氧化剂，更要防止膜被氧化。也有报道对硅污垢可用NH4HF2除去，对含铁的污垢可用亚硫酸钠溶液来去除。