正确的系统停机是膜系统良好运行的保证，在系统启动过程中，要防止高流量的给水/浓水（造成过高的压差）以及过快的升压（造成对膜元件的水力冲击）。
强烈建议减少系统停机的频率。
● 缓慢平稳地关闭进水阀门；
● 缓慢开启浓水阀门；
● 当高压泵出水流量达到*低时，关闭高压泵；
● 停机后应该对RO系统进行低压冲洗；
● 直到浓水电导率与进水电导率基本一致时可停止低压冲洗。低压冲洗的目的是为了清除膜系统中高含盐的浓水，可以进行高流量冲洗，注意压差不要超过2bar；
● 假如没有安装空气排泄阀，低压冲洗完成后，关闭浓水及产水阀门；
● 停机时注意产水背压不要超过0.7bar；
● 调整预处理加药状态。
反渗透纯水机投运后应随时使膜保持湿润。建议在浓水及产水低压管路上安装空气排泄阀，空气排泄阀一般高于*高位置的压力容器，通过这样的方法，虹吸很难发生。
反渗透纯水机系统短期停机
短期停机指停机半天以上，而小于4天的情况。停机注意如下：
●低压冲洗RO系统，同时赶出系统内的空气；
冲洗水温度：5-35℃；
冲洗水Ph：3-7
海水淡化系统：用预处理产水冲洗；
双级RO系统：用一级RO产水冲洗（不含任何化学药剂）。
●每隔12小时重复冲洗RO系统。
反渗透纯水机系统长期停机
短期停机指停机4天以上的情况。停机注意如下：
●在线清洗RO系统；
●系统清洗后用500-1000mg/L的SBS进行冲洗RO系统；
●确保RO系统填充好SBS溶液，关闭相关阀门；
●每隔一周检查保护液的Ph值；
●在下列情况下使用新鲜的保护液重复以上步骤
——假如温度低于27℃或Ph≤3，每隔30天或更短时间内重复以上步骤；
——假如温度高于27℃或Ph≤3，每隔15天或更短时间内重复以上步骤。