针对特定系统条件、水通量和脱盐率是反渗透膜的特性，而影响反渗透水处理设备系统的水通量和脱盐率因素较多，主要包括压力、温度、回收率、进水含盐量和PH值等影响因素。
1、压力
反渗透水处理进水压力直接影响分渗透膜的膜通量和脱盐率。膜通量的增加与分身体进水压力呈直线关系；脱盐率与进水压力成线性关系，但压力达到一定值后，脱盐率变化曲线趋于平缓，脱盐率步骤增加。
2、温度
脱盐率随反渗透进水温度的升高而降低，而产生通量则几乎呈线性地增大。主要是因为，温度升高，水分子的粘度下降，扩散能力强，因而产生通量升高；随着温度的提高，盐分透过反渗透膜的速度也会加快，因而脱盐率会降低。
3、含盐量
水中盐浓度是影响膜渗透压的重要指标，随着进水盐含量的增加，膜渗透压也增大。在反渗透进水压力不变的情况下，进水含盐量增加，因渗透压的增加抵消了部分进水推动力，因而通量变低，同事脱盐率也变低。
4、PH值
不同种类的膜元件使用的PH值范围差别较大，如醋酸纤维膜在PH值4～8的范围内产水通量和脱盐率趋于稳定，在PH值低于4或高于8的区间内，受影响较大。目前工业水处理使用的膜材料绝大多数为符合材料，适应的PH值范围较宽（连续运行情况下PH值可以控制在3～10的范围），在此范围内的膜通量和脱盐率相对稳定。
5、回收率
反渗透设备系统回收率的提高，会使魔元件进水沿水流方向的含盐量更高，从而导致膜渗透压增大，这将抵消反渗透进水压力的推动作用，从而降低了产水通量，魔元件进水含盐量的增大，使淡水中的含盐量随之增加，从而降低了脱盐率